Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AQP4P55087 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AQP4P55087 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AQP4P55087 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms