Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2A2P52657 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2A2P52657 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms