Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GPC3P51654 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms