Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
GCAP28676 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GCAP28676 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GCAP28676 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms