Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms