Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFE3P19532 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFE3P19532 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFE3P19532 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms