Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGAM1P18669 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms