Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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