Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
DMDP11532 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
DMDP11532 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
DMDP11532 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DMDP11532 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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