Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPTA1P02549 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPTA1P02549 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPTA1P02549 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPTA1P02549 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SPTA1P02549 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SPTA1P02549 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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