Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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CLDN9O95484 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CLDN9O95484 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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