Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
XIRP2A4UGR9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XIRP2A4UGR9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms