Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms