Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP15Q9Y4E8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP15Q9Y4E8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP15Q9Y4E8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP15Q9Y4E8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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USP15Q9Y4E8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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