Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS5Q9UPZ3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPS5Q9UPZ3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms