Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF24Q9UPV7 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms