Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNRF3Q9ULT6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms