Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTN3Q9P232 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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