Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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AMBRA1Q9C0C7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AMBRA1Q9C0C7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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