Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
HIGD2AQ9BW72 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms