Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HIRIP3Q9BW71 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms