Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms