Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YME1L1Q96TA2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms