Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRIQ1Q96JM4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRIQ1Q96JM4 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms