Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MSL3Q8N5Y2 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms