Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERC6Q8IVU3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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