Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTF1AQ7RTS3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms