Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC174Q6PII3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms