Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPPQ6IPU0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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