Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q499Y3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q499Y3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q499Y3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q499Y3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q499Y3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q499Y3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q499Y3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms