Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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KRTAP21-1Q3LI58 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MORC2-AS1-201ENST00000422995 2274 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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