Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms