Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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