Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ATRQ13535 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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