Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FMODQ06828 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
FMODQ06828 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FMODQ06828 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms