Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SUMO1P63165 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms