Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERVK_113P62684 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms