Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA8P48165 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms