Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SLC25A19-204ENST00000416858 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ATRXP46100 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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