Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJC1P36383 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJC1P36383 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.8 ms