Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA13P31271 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA13P31271 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms