Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GJB2P29033 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJB2P29033 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJB2P29033 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GJB2P29033 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJB2P29033 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJB2P29033 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms