Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRHP20396 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRHP20396 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRHP20396 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRHP20396 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TRHP20396 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRHP20396 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRHP20396 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRHP20396 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRHP20396 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRHP20396 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRHP20396 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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