Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NFKB1P19838 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NFKB1P19838 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NFKB1P19838 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NFKB1P19838 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NFKB1P19838 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NFKB1P19838 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NFKB1P19838 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NFKB1P19838 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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