Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DESP17661 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DESP17661 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DESP17661 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DESP17661 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms