Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RLBP1P12271 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms