Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPRCP08575 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms