Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBB4AP04350 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms