Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERPINC1P01008 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms