Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIPSNAP2O75323 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms